شعبة ترميم المخطوطات :
تعنى هذه الشعبة بتعقيم المخطوطات المصابة بيولوجيًّا ومعالجتها كيميائيًّا؛ لتطهيرها من تلك الإصابات، وترميم ما تلف واهترى داخل المخطوطات، بأساليب فنية علميّة، بما يتناسب مع تلك الإصابات، ثمَّ تجليدهابغلاف ذي طابع فني إسلامي، يتناسب مع تاريخ صناعتها ونسخها، وتصنيع جميع أنواع العلب الخاصة بحفظ الوثائق والكتب والمخطوطات.
شعبة ترميم المطبوعات :
أسست هذه الشعبة في أكتوبر من عام 1999 م وتعنى بتعقيم جميع أنواع المطبوعات من الإصابات البيولوجية، ومعالجتها كيميائيًّا؛ من الآثار المدمرة لها مثل الأحماض الزائدة والتكسر والتقصف والألوان القاتمة بسبب الأكسدة الضوئية، وأسباب أخرى عديدة، ومن ثَمّ ترميمها وتقويتها وتدعيمها بالطرق الآلية الحديثة.
شعبة التجليد الحديث:
شعبة استخراج الألياف السيللوزية النقية :
أسست هذه الشعبة في أكتوبر من عام 1999م وتختص باستخراج الألياف السيللوزية النقية من خامات طبيعية، بما يتناسب مع المواصفات العالمية، من حيث الطول والنقاء والوسط الكيميائي المعتدل، وذلك لاستخدامها في كل أعمال الترميم اليدوية والآلية، حيث تعدّ هذه المادة العمود الفقري لكل تلك الأعمال.أما الأعمال التي يقوم بها القسم فهي : أولا: على صعيد المركز :1- المعاينة الدورية والمستمرة للأوعية الثقافية المتنوعة ) مخطوطات – مطبوعات ( في المستودعات، والكشف عليها، وبيان حالاتها الصحية وتحديدها.2 - المعالجات الكيميائية والبيولوجية كاملة.3 - الترميم بكل أنواعه اليدوي والآلي والحراري.4 - التجليد الإسلامي للمخطوطات ، والتجليد الفني الحديث للمطبوعات 5 - استخراج الألياف السيللوزية النقية لأعمال الترميم.6 - وضع الدراسات اللازمة لتطوير العمل وتحديثه بما يتناسب مع حركة التطوير في العالم ثانيا : على الصعيد العربي والدولي : 1- تنظيم العديد من الدورات التدريبية في الحفظ والمعالجة والترميم عربيًّا ودوليًّا في داخل الدولة وخارجها.2- المشاركة في تنظيم المؤتمرات البحثية وورشات العمل التخصصية.3- تقديم أجهزة الترميم وموادها اللازمة وتشغيلها في العديد من المراكز العربية والإسلامية، التي تجاوزعددها 20 مركزاً.4- تنظيم المعارض الفنية الخاصة بفنون المخطوط العربي الإسلامي.